拳皇96的剧情还要追溯到1800年前！
那个时候，由地球意志形成的生命体大蛇，因为感觉人类令世界失衡，所以计划对人类进行灭绝性打击！
但因为大蛇没实体，需要进化变成完全体才可毁灭人类！
于是大蛇命令八杰集，去捕捉素盖鸣尊的八个女儿（八稚女）作祭品，来进行觉醒与进化。
其中七个成功被捕捉，但就在还差一个“奇稻田姬”的时候，大蛇八杰集却被草薙、八尺琼和八咫三个家族击败！
无奈的大蛇唯有利用手上的七稚女以不完全的形态觉醒。
结果实力不足的大蛇被这三个人类家族打倒并将他封印。
三大家族用来对付大蛇的三件法具被后世称为“草薙剑”、“八尺琼勾玉”和“八咫之镜”，总称”“三神器”。
在660年前，八琼一族因希望得到大蛇之力而把大蛇的封印解除，八杰集的灵魂逃出封印，并以转生的形态存在于世界之中，开始计划令大蛇复活。
时间很快来到了0世纪末，这个时候，最强悍的八杰集之一，息吹之岚——暴风高尼茨终于觉醒了！
为了解除大蛇的封印，高尼茨找到了三神器家族之一，改姓为“神乐”的八咫家，杀害了当时守护大蛇封印的神乐万龟（神乐千鹤的姐姐），并利用她的血削弱了大蛇的整体封印，解放了大蛇的魂魄，让所有的八杰集成员都获得了对应的大蛇之力，而高尼茨本人也获得了“风”的大蛇之力。
其后高尼茨游走世界，接连策划了一系列事件，包括赐给了卢卡尔一滴大蛇之血！
KOF95的时候，卢卡尔因为承受不住大蛇之血而惨遭反噬，而一直关注大蛇一族动向的神乐千鹤发现了这件事，预感到大蛇一族将要卷土重来，于是举办了KOF96大赛。
神乐千鹤的本意是希望以此凑齐三神器重新封印大蛇八杰集，只可惜，暴风高尼茨的力量却强大到了超乎想象的程度！
“刷！”
江帆再次出现，已经来到了一片夕阳笼罩的庞大都市当中！
而此刻，他就站在一座摩天大厦的天台之上。
与此同时，系统的提示音已经陡然响起！
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